Rencana Strategis (Renstra) PSBM disusun dalam sebuah tim kecil, yang terdiri dari beberapa peneliti di PSBM dan pihak-pihak terkait yang merupakan pemangku kepentingan dalam bidang perikanan dan kelautan (stakeholder). Konsep Renstra ini kemudian didiskusikan oleh tim dengan meminta berbagai pendapat dari para pimpinan struktural jurusan, kepala laboratorium, dan dosen bahkan beberapa karyawan pendukung yang akan menjadi tulang punggung dalam pengelolaan implementasi Renstra. Penentuan waktu dan usulan kegiatan yang ditetapkan dalam Renstra diusulkan kepada Ketua LPPM untuk dimandatkan kepada Koordinator PSBM. Renstra tersebut ditetapkan sebagai rencana aksi dalam bentuk implementasi program lebih lanjut yang terarah dan dilakukan secara terpadu dan berkesinambungan.